蛋白質分子對接（Docking）是分子模擬的重要方法之一，其基礎是兩個或多個蛋白質之間的嵌入過程，其過程涉及蛋白質分子之間的空間識別和能量優化。蛋白質分子對接方法在藥物設計、致病機轉等領域有廣泛的應用。

本中心提供多種生物資訊分析方法，包含蛋白質結構分析(Structural Analysis)、蛋白質結構模擬(Structural Modeling)以及蛋白質對接計算(Molecular Docking)等服務技術，搭配PyMol、SWISS-MODEL以及HADDOCK軟體，進行相關模擬計算。未來將可應用於蛋白質藥物設計模擬以及臨床疾病機轉解釋。